Filogeografia de Adenomera aff. hylaedactyla no Nordeste brasileiro
Amphibians; Population Genetics; Genetic Diversity; Biodiversity
Os anfíbios são animais bastante sensíveis por natureza, afetados constantemente por alterações ambientais e mudanças climáticas. Essa sensibilidade os torna animais importantes de serem estudados, podendo ser bons indicadores de condições ambientais. Neste estudo avaliamos a diversidade genética de três populações no estado de Pernambuco do grupo taxonômico Adenomera aff. hylaedactyla (Anura, Leptodactylidae), buscando identificar padrões e diferenças genéticas entre as populações, e possíveis influências do ambiente. Para isto, foi feita a extração, amplificação e sequenciamento de amostras de tecido de dezessete indivíduos utilizando os marcadores moleculares COI e 16S, posteriormente foi feito o alinhamento e os dados foram submetidos a análises. A partir do alinhamento foi analisada a quantidade de sítios conservados e variados. Calculamos o valor do índice de fixação (Fst) para quantificar a diferenciação genética entre as populações e um teste AMOVA para avaliar a variação genética entre as populações. Foi utilizado o Geneland no método de probabilidade MCMC para avaliar a estruturação populacional das amostras com dados genéticos georreferenciados. Foi gerada também uma rede de haplótipos para melhor visualização de como os haplótipos encontrados estão distribuídos e relacionados. Encontramos a ocorrência de um GAP no indivíduo único que representa uma das populações amostradas, podendo indicar uma característica de deleção em tal população. Foi visto também que a maioria dos haplótipos encontrados são exclusivos da população mais a sul, e que as populações estudadas formam clusters geográficos, pois geneticamente são bastante semelhantes.
Palavras-chave: Anfíbios; Genética de populações; Diversidade genética; Biodiversidade
Abstract: Amphibians are naturally highly sensitive animals, constantly affected by environmental and climate changes. This sensitivity makes them important subjects of study, as they can serve as effective indicators of environmental conditions. In this study, we evaluated the genetic diversity of three populations in the state of Pernambuco belonging to the taxonomic group Adenomera aff. hylaedactyla (Anura, Leptodactylidae), aiming to identify genetic patterns, differences among populations, and possible environmental influences. Tissue samples from seventeen individuals were extracted, amplified, and sequenced using the molecular markers COI and 16S. The sequences were subsequently aligned, and the data analyzed. Based on the alignments, the number of conserved and variable sites was assessed. We calculated the fixation index (Fst) to quantify genetic differentiation among populations and performed an AMOVA test to evaluate genetic variation within populations. Geneland’s MCMC probability method was applied to infer population structure using georeferenced genetic data. Additionally, a haplotype network was constructed to better visualize the distribution and relationships of haplotypes. We detected a gap in a single individual from one of the sampled populations, which may indicate a deletion within that population. Furthermore, most of the haplotypes identified were exclusive to the southernmost population, and the studied populations formed geographic clusters, reflecting their high genetic similarity.