A nefrite lúpica (NL) é uma das características clínicas mais comuns do Lúpus Eritematoso Sistêmico e atinge até 70% dos pacientes. Além disso, é um dos sintomas que mais provocam morbidade e mortalidade nos pacientes com a doença. A busca por um biomarcador mais específico e que consiga predizer a resposta e o direcionamento do tratamento da NL é um desafio para a clínica. Entre os biomarcadores propostos, fatores genéticos associados a resposta inflamatória e imunológicas têm sido amplamente estudados. Nesse contexto, a Via WNT βcatenina tem sido apontada com um papel importante nas doenças inflamatórias crônicas e aut oimunes. A partir disso, o presente trabalho buscou avaliar o perfil de expressão gênica de genes da via WNT de sinalização ( DKKI, SOST, LRP5, WNT2, WNT16 e BMP2) em diferentes momentos durante o tratamento da NL, por meio de um estudo prospectivo. Foram selecionados doze pacientes para o estudo avaliados clinicamente e que estavam de acordo com os critérios do estudo. Além disso,foram realizadas coletas de sangue periférico, para a posterior extração do RNA e síntese do cDNA, e análise de expressão gênica. As coletas foram realizadas no início da terapia de indução para a NL e 3 meses após o segmento de tratamento. Nossos resultados mostraram que o Score do SLEDAI e a dose de prednisona mostraram diferenças estatisticamente significativas quando comparados os tempos 0 e após 3 meses de tratamento (p = 0,01). Entretanto, a análise da expressão gênica não demonstrou diferença significativa entre os genes avaliados nos diferentes momentos avaliados. Desse modo, concluímos que o período de 0 a 3 meses para os parâmetros avaliados não foi suficiente para se obter resultados significativos tanto dos parâmetros clínicos e laboratoriais, quanto para o padrão de expressão dos genes avaliados, necessitando assim de um maior período de acompanhamento da coorte em estudo.

Dentre as complicações clínicas da anemia falciforme (AF), o acidente vascular cerebral (AVC) é a de maior gravidade. A ultrassonografia com Doppler transcraniano (DTC) é uma ferramenta de triagem que pressagia o risco de AVC, levando ao início da terapia profilática, mas apresenta algumas limitações intrínsecas, sendo necessária a identificação de novos indicadores que o auxiliem. O CAV1 um interessante modulador molecular para avaliação desse risco sendo responsável por codificar a proteína caveolina-1, que regula vias de sinalização e processos que estão envolvidos com a fisiopatologia do AVC na AF, principalmente por regular negativamente a biodisponibilidade do óxido nítrico (NO), importante vasodilatador. Para este estudo foram selecionados 3 polimorfismos no gene CAV1: rs3807989, rs7804372 e rs1997623. Selecionamos 339 indivíduos com AF menores de 20 anos de idade acompanhados na Fundação de Hematologia e Hemoterapia de Pernambuco (HEMOPE), Recife-PE. As genotipagens para os polimorfismos ocorreram por PCR em tempo real com discriminação alélica utilizando sondas TaqMan no aparelho QuantStudio® 5. Os polimorfismos rs3807989 e rs7804372 não se mostraram associados estatisticamente com as variáveis analisadas. Já o rs1997623 demonstrou associação estatisticamente relevante com o AVC (p=0,003) e Doença Cerebrovascular (P=0,011). Além disso, o alelo selvagem "A" demonstrou estar mais relacionado com o  AVC (P = 0.0032; OR: 2.568; IC: 1.374 – 4.655) e com a DCV (P = 0.0092; OR: 1.950; IC: 1.205 – 3.160) quando  comparado ao alelo mutado "C", conferindo ao rs1997623 caráter protetivo contra essas condições avaliadas, sendo necessários ainda estudos futuros para a confirmação destes resultados visto que o AVC é uma doença multifatorial.

A síndrome de Turner (ST) é uma das cromossomopatias mais frequentes em humanos, acometendo cerca de 1:2500 nascimentos do sexo feminino. Essas pacientes apresentam um risco duas vezes mais elevado de desenvolver doenças autoimunes e desordens inflamatórias comparadas às mulheres em geral. Vários genes que estão envolvidos com o contexto imune e inflamatório vêm sendo avaliados e relatados quanto ao risco às desordens inflamatórias e imunes na ST. Contudo, não há relatos sobre a possível associação de alterações no perfil de ativação do inflamassoma nesta sindrome. Dessa forma, o objetivo deste trabalho foi determinar se polimorfismos nos genes rs16944 IL-1β e rs10754558 e rs4925659 NLRP3, bem como se o perfil de expressão destes genes conferem susceptibilidade às desordens inflamatórias na ST, comparando ao grupo controle.
Este estudo compreendeu 92 pacientes com ST (caso) com ou sem história de doenças inflamatórias e 146 mulheres saudáveis (controle). A análise dos polimorfismos foi realizada utilizando o sistema Taqman e os dados foram analisados pelo programa SNPStats, com nível de significância de 0,05. Associações estatisticamente significantes foram observadas no alelo G de rs16944 (A>G) (p=0.001, OR=1.83) e genótipo GG (p=0.002, OR=3.09) no grupo caso comparado ao controle. Em contraste, não foram observadas diferenças na distribuição de rs10754558 (G>C) entre caso e controle (p=1.0 e p=0.6). Não detectamos o genótipo homozigoto AA de rs4925659 (G>A) em TS, e o alelo G e o genótipo GG foram significativamente mais frequentes em controles do que em TS (p=0.02, OR=0.61), embora nossa população para este polimorfismo não esteja no equilíbrio de Hardy-Weinberg. Nossos resultados sugerem uma possível associação do polimorfismo IL-1β rs16944 e o risco de desordens inflamatórias em pacientes com ST.

A COVID-19 apresenta manifestações clínicas que vão desde a ausência de sintomas até complicações graves. Diferentes desfechos podem estar relacionados a fatores como: idade, sexo, morbidades e variabilidade genética viral e do hospedeiro. Polimorfismos em genes envolvidos em coagulopatias têm sido associados a resultados graves de COVID-19. Investigamos a distribuição alélica e genotípica de polimorfismos de nucleotídeo único (SNPs) nos genes ACE2 (rs228566), MTHFR (rs1801133) e ANXA2 (rs7163836 e rs7170178) e sua possível relação com a gravidade da COVID-19. Foram coletadas 312 amostras de swab nasofaríngeo de indivíduos com COVID-19 e o DNA genômico extraído. Os indivíduos foram estratificados em COVID-19 leve, grave e fatal. A genotipagem foi realizada por qPCR, usando sondas alelo-específicas. Nos casos leves, febre e tosse foram os sintomas mais frequentes (>76% em ambos). Nos casos graves, tosse (89,1%), baixa saturação (82,6%) e dispneia (78,3%) foram mais comuns. Nos casos fatais, os sintomas mais comuns foram dispneia (85,7%), baixa saturação de oxigênio e tosse (ambos 75,7%). Doenças cardiovasculares (29,3% e 15,7% respectivamente) e diabetes mellitus (25% e 14,3% respectivamente) foram as morbidades mais frequentes entre graves e fatais. Apenas o polimorfismo rs7170178 em ANXA2 foi associado. O genótipo AG foi significativamente mais frequente entre os casos fatais, sugerindo maior suscetibilidade à mortalidade da doença. Novos estudos envolvendo outras variantes do ANXA2 devem ser realizados para confirmar o papel desse gene nos diferentes desfechos clínicos da COVID-19.

A fim de se obter uma melhor estratificação de risco, o impacto de alterações moleculares tem sido amplamente estudado em pacientes com leucemia mieloide aguda (LMA). Além de alterações estruturais e mutações no DNA, expressão aberrante de genes podem influenciar o curso clínico da doença. Nesse contexto, os membros da família PARP (do inglês, Poly(ADP-ribose) polymerases) (PARP1, PARP2 e PARP3), responsáveis por codificar proteínas capazes de exercer modificações pós-traducionais relacionadas a diversos processos celulares, foram descrito como importantes preditores de prognóstico em pacientes com tumores sólidos, embora pouco se saiba do seu impacto clínico na LMA. Este trabalho teve como objetivo avaliar a expressão dos genes PARP1, PARP2 e PARP3 e seu impacto nos desfechos clínicos de paciente adultos com LMA. Ao todo, 3 coortes independentes foram analisadas (Recife: 81 pacientes, TCGA: 173 pacientes e GSE6891: 245). Na coorte de TCGA e GSE, a expressão de PARP2 e PARP3 foi maior em pacientes com cariótipo complexo (p<0,001) e risco desfavorável (p<0,001). Além disso, a expressão aberrante de PARP2/3 teve impacto direto na sobrevida dos pacientes (PARP2, coortes TCGA (p=0,036) e GSE (p=0,006); PARP3, coortes TCGA (p=0,003) e GSE (p=0,001). A exemplo de tumores sólidos,
a expressão aberrante de PARP2/3 pode predizer um pior desfecho em pacientes adultos com LMA.

Tripanosomatídeos são protozoários flagelados que englobam agentes patogênicos dos gêneros Leishmania e Trypanosoma. Esses organismos exercem um controle da expressão gênica através de eventos predominantemente pós-transcricionais, muitos envolvendo o controle da estabilidade e tradução de RNAs mensageiros (mRNAs). Dentre as diferentes proteínas de ligação ao RNA (RBPs) participantes nesses eventos, a mais relevante deve ser a proteína de ligação à cauda poli-A (PABP). Três de seus homólogos foram identificados em Leishmania, todos estruturados em uma região N-terminal com quatro motivos de reconhecimento ao RNA (RRMs 1 a 4), uma região linker intermediária e um domínio MLLE presente na sua região C-terminal. O primeiro dos homólogos, a PABP1 se mostrou indispensável e fortemente ativa durante a tradução, além de uma associação com mRNAs diferentes dos associados às PABPs 2 e 3. Também foi observada uma forte afinidade da PABP1 para o complexo eIF4F baseado nas subunidades EIF4E4 e EIF4G3, com uma interação inédita identificada entre a PABP1 e o EIF4E4. Isoformas fosforiladas da PABP1 a indica como potencial alvo de processos regulatórios. Portanto, o presente estudo objetiva melhor compreender a atividade da PABP1, avaliando o papel de diferentes regiões desta proteína, incluindo sítios de possíveis interações proteína-proteína, na sua interação com outras proteínas parceiras, como a proteína de ligação a RNA denominada de RBP23. Ele dá continuidade a estudos prévios onde foram gerados mutantes em motivos julgados relevantes nos RRMs 1 e 2, na região linker e no domínio MLLE. Neste trabalho, diferentes construções mutantes nos RRMs 3 e 4 foram geradas por mutagênese sítio-dirigida e avaliadas quanto ao seu potencial de complementação após a deleção das duas cópias dos genes da PABP1 no genoma de Leishmania infantum. Como resultados preliminares, o mutante PABP1_MLN, no RRM4,levou a uma diminuição no crescimento celular, e a proteína mutada se mostrou incapaz de complementar a ausência do gene PABP1 endógeno. Para todo o conjunto de mutantes disponíveis, estes foram avaliados em ensaios de imunoprecipitação in vivo, e as amostras obtidas analisadas por espectrometria de massas, visando avaliar cada uma das regiões da proteína frente à interações novas e já estabelecidas. Esse trabalho contribuirá no entendimento acerca da especificidade da PABP1 aos seus mRNAs alvos, bem como a participação de diferentes motivos nas interações estabelecidas por esta na durante a iniciação da tradução de tripanosomatídeos.

Existe uma sub-representação do estado de Pernambuco em estudos genético-populacionais com marcadores Y-STRs, bem como no banco de dados mundial YHRD, sabidamente referência para diversas análises. Esse fato, somado à importância antropológica em apresentar detalhes da história popul acional local, justificam o presente trabalho, que objetivou caracterizar as linhagens paternas e fornecer dados de interesse forense local para uma amostra da população de Pernambuco, por meio de um conjunto de 23 marcadores microssatélites do cromossomo Y (Y-STRs). Para este fim, 172 amostras masculinas oriundas de três mesorregiões do interior do estado foram coletadas e genotipadas utilizando o sistema multiplex PowerPlex ®Y23 (Promega Corporation). Os parâmetros forenses de frequências alélicas (FA), frequências haplotípicas (FH); diversidade gênica (DG), diversidade haplotípica (DH), capacidade de discriminação (CD) e probabilidade de coincidência haplotípica (PCH) foram calculados utilizando o programa Arlequin 3.5.1.2, e a inferência dos haplogrupos foi realizada através da plataforma online Haplogroup predictor – HAPEST. Os dados obtidos para os parâmetros analisados evidenciam a eficiência do kit PowerPlex Y23 na fração da população pernambucana para fins de validação forense, revelando uma alta diversidade gênica para os loci presentes, alta capacidade de discriminar haplótipos entre indivíduos aleatórios na população e baixa probabilidade de coincidir um mesmo haplótipo para dois indivíduos não aparentados, e a inferência de haplogrupos baseada em haplótipos dos Y-STRs corroborou com a estrutura de patrilinhagens já indicada para os demais estados brasileiros, sendo condizente com a história local de ocupação humana

As características genéticas do hospedeiro colaboram expressivamente na compreensão de mecanismos envolvidos na susceptibilidade às infecções. Estudos demonstram que SNPs em TRIM5 e TRIM22 possuem impacto funcional na atividade antiviral, restringindo a replicação viral e modulando a suscetibilidade à infecção pelo HIV-1. Neste sentido, o presente trabalho se propôs a avaliar as distribuições dos SNPs rs3740996, rs10838525, rs7935564 e rs1063303, e as suas relações com a transmissão vertical do HIV-1. O estudo envolveu 208 mulheres infectadas pelo HIV-1 e seus filhos, acompanhados no IMIP-PE. Através da caracterização clínica foi verificada a importância das medidas profiláticas. Os alelos G (rs3740996), C (rs10838525), A (rs7935564) e G (rs1063303) foram os mais frequentes entre as crianças expostas infectadas (88,4%, 81,0%, 54,5%, 55,8%, respectivamente) e não-infectadas (86,6%, 76,7%, 56,5%, 60,4%, respectivamente), bem como entre as mães transmissoras (89,9%, 82,6%, 51,8%, 57,2%, respectivamente) e não transmissoras (88,9%, 79,85%, 52,7%, 54,4%, respectivamente). Os genótipos G/G (rs3740996), C/C (rs10838525), A/G (rs7935564) e C/G (rs1063303) foram os mais frequentes entre as crianças expostas infectadas (76,8%, 67,8%, 50,0%, 41,9%, respectivamente) e não-infectadas (74,1%, 59,3%, 41,9%, 43,4%, respectivamente), bem como entre as mães transmissoras (82,1%, 66,3%, 57,3%, 54,2%, respectivamente) e não transmissoras (79,5%, 64,7%, 55,8%, 45,1%, respectivamente). No entanto, não foram encontradas associações significativas entre esses SNPs e a infecção pelo HIV-1. Novos estudos devem ser realizados para melhor compreensão da relação dessas variantes com a susceptibilidade ao HIV-1.

A videira (Vitis vinifera L.) apresenta significativa importância social e econômica no Brasil. Entretanto, sua produtividade é frequentemente afetada, devido à ocorrência de estresses. Nesse contexto, as modificações epigenéticas compreendem ampla funcionalidade, sendo os processos de metilação e demetilação do DNA participantes diretos no mecanismo de combate ao estresse biótico. Esses processos são desenvolvidos pelas enzimas metiltransferases (MTases) e demetilases (dMTases), respectiavamente. O presente trabalho objetivou caracterizar e analisar a modulação da expressão dessas enzimas no transcriptoma da videira inoculada com Xanthomonas citri pv. viticola (Xcv). Foram identificadas no transcriptoma em questão seis VvMTases e três VvdMTases, todas apresentando domínios característicos de tais grupos de enzimas. A análise fenética indicou grupos de MTases e dMTAses diversificados, correspondentes às suas respectivas subfamílias, sendo possível confirmar a classificação previamente realizada a partir da identificação dos domínios. Adicionalmente, foram
identificados no genoma da videira 12 loci codificadores de VvMTases e 3 de VvdMTases. Os promotores das VvMTases associaram-se aos fatores de transcrição AP2-EFR, Dof-type e WRKY, indicando uma ampla funcionalidade, incluindo resposta a estresse. Além disso, um alto índice de conservação dessas enzimas foi encontrado nos membros de diferentes famílias como, por exemplo, Fabaceae e Euphorbiaceae. Para o tempo de 90 minutos, os dados de transcriptômica indicaram expressão constitutiva para VvMTases e VvdMTases ao
longo de todo ensaio. Essas enzimas com expressão constitutiva devem, portanto, ser potencialmente exploradas quanto à sua participação nos mecanismos de defesa vegetal.

Dípteros necrófagos são frequentemente encontrados em locais de crime, seus espécimes, principalmente imaturos, auxiliam desde a estimativa do intervalo pósmorte a identificação de vítimas e suspeitos, em todos os casos a identificação do material biológico periciado é uma etapa crucial a qual vem contando com o auxílio da biologia molecular. Busca por marcadores moleculares robustos e metodologias sensíveis são de suma importância para corroborar na eficácia das atividades periciais. Desta forma, o presente trabalho objetivou comparar dois marcadores moleculares mitocondriais úteis para a técnica barcode em dípteros e criar um protocolo para recuperação de Short tandem repeat (STR) humano presente no conteúdo estomacal de dípteros larvais. Os dípteros foram coletados nas dependências dos Institutos de Medicina Legal da Paraíba e Pernambuco e adicionalmente foram utilizadas amostras da coleção entomológica da Universidade de Brasília. A extração do DNA ocorreu utilizando fenol-clorofórmio e Chelex 10%, em seguida foram sequenciadas as regiões COI e CytB dos dípteros, realizada buscas por sequencias homologas no NCBI através de BLASTn e uma análise de distância genética foi executada no software MEGA. O perfil humano presente no conteúdo estomacal das larvas será amplificado com o PowerPlex® Fusion System kit, analisado no GeneMapper e comparado com perfis de referência. Os resultados da identificação de dípteros mostram que a região do CytB proposta como barcode revelou-se mais robusta, apresentado valores de distância genética superiores a 150% aos do COI. Estes resultados contribuirão na eficiência da taxonomia molecular e proporcionaram celeridade nas atividades periciais.

A infecção por Zika vírus é associada a graves malformações fetais e complicações neurológicas em adultos, representado risco a saúde pública. No entanto, ainda não existem vacinas licenciadas para uso humano. Vacinas de DNA são plataformas altamente adaptáveis, eficientes, seguras e possuem rápida produção e bom custo-benefício. Neste trabalho, propomos o desenvolvimento dois candidatos a vacina de DNA contra o ZIKV, e avaliação imunológica destas em ensaios com camundongos Balb/c. Para isso, foram selecionados 14 epítopos presentes nas proteínas do Envelope e NS1, preditos in silico como indutores de respostas mediadas por células T e B. Adicionamos ao peptídeo sinal ssPGIP a um dos candidatos, como estratégia de otimização da imunogenicidade vacinal. As sequências foram clonadas no vetor de pVAX para expressão em mamíferos e utilizadas para a imunização de camundongos BALB/c. Após o encerramento cronograma de imunização (28 dias), o sangue e baços dos animais foram coletados para análises bioquímicas, hematológicas, imunofenotipagem, isotipagem e análise de citocinas. Até o presente momento, temos indícios que as duas vacinas de DNA testadas, pVAX_EnvNS1 e pVAX_ssEnvNS1, foram capazes de ativar linfócitos T CD4+ e T CD8+, bem como gerar resposta imune humoral de perfil Th1. Os dados obtidos indicam que a imunização com pVAX_ssEnvNS1 resulta em perfil polifuncional com produção de citocinas dos perfis Th1, Th2 e Th17. Enquanto que a ativação de células T CD4+ e CD8+ observada para pVAX_EnvNS1 foi mais robusta e persistente. Como próximo passo, serão realizados ensaios de neutralização por redução de placas que auxiliaram na composição do perfil imunogênicos dos candidatos vacinais

A disseminação de Klebsiella pneumoniae resistente aos carbapenêmicos e o aumento do uso das polimixinas para tratamento de infecções causadas por esses microrganismos, contribuiu para a emergência de isolados resistentes a esses fármacos. Este estudo objetivou avaliar a relação genética e resistência à colistina e outras drogas em isolados de K. pneumoniae de um hospital universitário do Recife. Foram estudadas 16 cepas coletadas de 2014 a 2016, que tiveram o perfil de susceptibilidade aos antimicrobianos determinado por automação. A relação clonal foi estabelecida utilizando eletroforese em gel de campo pulsado e tipagem de sequência multilocus. A resistência à colistina foi avaliada em relação à presença do gene mcr, alterações nos genes dos sistemas de dois componentes - TCSs (phoPQ e pmrAB) e integridade do gene mgrB. A Identificação dos genes de beta-lactamases (blaKPC, blaTEM, blaCTX, blaSHV) também foi executada. Três pulsotipos foram definidos e a maioria dos isolados pertencem ao ST11. Um deles pertence ao ST3990, ainda não relatado. As sequências de inserção ISKpn13 e IS903B foram identificadas interrompendo o mgrB. Mutações foram observadas nos genes pmrB, phoP e phoQ. O gene mcr não foi detectado. Todos os isolados apresentaram mais de um gene de beta-lactamase. Esses resultados destacam a frequência de interrupção insercional do mgrB e mutações nos genes dos TCSs mediando a resistência à colistina em isolados policlonais de K. pneumoniae multirresistentes em um hospital público do Recife.

A fitoterapia é utilizada pelo Sistema Único de Saúde (SUS) no Brasil para atender a atenção primária. Mas antes de serem utilizadas pelo SUS, as plantas precisam de comprovação quanto às suas propriedades biológicas e toxicológicas. No presente trabalho, extrato aquoso das cascas de Commiphora leptophloeos (Mart.) J.B.Gillett (Burseraceae) foi avaliado quanto ao potencial antioxidante, citotóxico, genotóxico e antigenotóxico. A decocção do material seco foi realizada para extração dos metabólitos, seguida de liofilização. Para avaliar o potencial antioxidante foram utilizados os testes DPPH, ABTS, fosfomolibdênio e poder redutor em 11 concentrações, variando de 0,39 a 200 μg/mL. Os valores de EC50 foram determinados para cada teste: 5,00; 4,45; 42,15 e 38,62 μg/mL, respectivamente. As células de fibroblastos de murinos (L929) foram empregados para avaliar a citoxicicidade, genotoxicidade e antigenotoxicidade. No primeiro teste, nenhuma das concentrações utilizadas (13 concentrações variando entre 1,56 e 6400 μg/mL) alterou a viabilidade celular. No segundo teste, nenhuma das concentrações avaliadas (6,25, 25, 100 e 400 μg/mL) apresentou genotoxicidade. Por outro lado, a concentração de 200 μg/mL não exibiu antigenotoxicidade contra o metil metanossulfonato. Dessa forma, observa-se que o extrato aquoso das cascas de C. leptophloeos apresenta potencial antioxidante promissor com ausência de citogenotoxicidade, com base nos testes realizados, indicando o referido extrato para compor a fitoterapia do sistema de saúde do Brasil. 

O déficit hídrico é um dos principais fatores limitantes da produtividade da cana-de-açúcar, comprometendo o desenvolvimento planta, podendo ocasionar perda do canavial. Associação de plantas com organismos simbiontes como fungos micorrízicos arbusculares (FMAs) podem mitigar os efeitos do déficit hídrico, por modular a expressão de genes, acúmulo de proteínas e produção de metabólitos. Entretanto, existem poucas informações na literatura sobre os mecanismos envolvidos neste processo em plantas ocasionado pela associação com FMAs. O objetivo deste trabalho foi analisar as alterações fisiológicas e proteômicas das raízes de cana-de-açúcar associados a FMAs e submetidas ao déficit hídrico. Variedades de cana-de-açúcar (RB867515 e RB041443) foram propagdas em vasos inoculados ou não com esporos de Dentiscutata heterogama (FMADH) ou de Claroideoglomus clarum (FMACC). Após quatro meses de inoculação, metade dos vasos foram submetidos ao estresse por déficit hídrico por sete dias. Posteriormente, foi retomado o fornecimento de água para a realização de análises de reidratação. A análise proteômica foi realizada utilizando a variedade RB867515 submetida ao déficit hídrico, inoculadas ou não pelo FMADH. As proteínas radiculares foram extraídas pelo método fenólico, quantificadas pelo método de Bradford, e digeridas por tripsina. Os peptídeos obtidos foram submetidos à espectrometria de massas do tipo ESI-Q-ToF Synapt G2S (Waters). Os espectros obtidos foram analisados no programa Progensis QI (Waters) para identificação das proteínas diferencialmente acumuladas (DAPs). As DAPs foram agrupadas por processo biológico por meio do programa Blast2GO e observado a interação entre elas por meio do programa Cytoscape. Foi identificado um total de 399 proteínas, destas 29 são DAPs, das quais 5 foram do tratamento não-inoculado com FMA e 24 do tratamento inoculado com FMA. Dentre as proteínas identificadas, destaque para a proteína Receptor de ácidoabscisíco PYL10 mais acumulada no tratamento inoculado com FMA. Esta proteína é um receptor de ABA, envolvida com respostas a estresse, inibe a proteína fosfatase PP2C, permitindo que transcrição de genes que regulam inúmeras respostas na planta. Portanto, os dados obtidos podem auxiliar na elucidação dos mecanismos de tolerância da cana-de-açúcar ao déficit hídrico associado a FMAs e no desenvolvimento de variedades mais tolerantes.

   Pseudomonas aeruginosa é um patógeno oportunista capaz de infectar pacientes queimados ou imunocomprometidos em hospitais e ambientes de assistência à saúde. Uma das principais causas de infeções hospitalares causadas por P. aeruginosa é devido a sua resistência intrínseca aos antimicrobianos e produção de biofilme. O sistema CRISPR/Cas é definido como um mecanismo de defesa de procariotos contra elementos genéticos móveis (MGEs), composto por um loco CRISPR, formado por sequências repetitivas intercaladas por espaçadores e genes cas. O trabalho teve como objetivo uma análise de isolados de P. aeruginosa comportando o sistema CRISPR/Cas. Dos 12 isolados analisados, 83% abrigam o sistema tipo I-F e 17% o sistema tipo I-E. Apesar de existirem outros tipos de sistema CRISPR em P. aeruginosa, o tipo I-F é o mais encontrado nos isolados. Os espaçadores encontrados para o tipo I-F correspondem a sequências de bacteriófagos e plasmídeos, corroborando com o princípio de funcionamento do sistema CRISPR/Cas. Foi observado a presença de genes anti-CRISPR e profagos inseridos nos genomas desses isolados. A presença dos STs compartilhados entre setores e entre hospitais permitiu traçar uma rota de disseminação desses isolados. Entretanto, a aplicação do loco CRISPR como uma ferramenta molecular para tipagem, se mostrou ineficaz em P. aeruginosa. Nossos resultados fornecem informações sobre a genética básica estrutural do loco CRISPR, o que vem a contribuir com a geração de conhecimentos sobre o sistema CRISPR/Cas em P. aeruginosa.

O feijão-caupi [Vigna unguiculata (L.) Walp] representa a principal leguminosa cultivada nas regiões Norte e Nordeste. No entanto, essa cultura sofre graves perdas às custas de fatores ambientais adversos, incluindo a seca. Quando as plantas enfrentam estresses ambientais, os fitohormônios atuam como transdutores de sinal,
promovendo respostas específicas às plantas. O presente trabalho teve como objetivo caracterizar a expressão de genes envolvidos nas vias de sinalização de fitohormônios, em V. unguiculata, após a exposição das raízes ao ar (150 min.). Para esse fim, unitags SuperSAGE (de 26 pb) de feijão-caupi, provenientes de dois acessos
diferentes em resposta à seca, foram alinhadas (via BlastN) aos transcritos de feijãocaupi associados a nove vias de sinalização de fitohormônio (auxina, citocinina giberelina, ácido abscísico, etileno, jasmonato, brassinoesteóides, ácido salicílico e estrigolactonas). Dos 625 transcritos relacionados a essas vias, 320 foram
diferencialmente expressos (DE) após o estímulo aplicado (p <0,05). No perfiltolerante (acesso Pingo de Ouro), os transcritos UR (induzidos), DR (reprimidos) e n.s., ao nível de p <0,05, foram 175, 50 e 95, respectivamente. No perfil sensível (Santo Inácio), esses números foram 132, 130 e 58, respectivamente. Paralelamente,
uma análise do enriquecimento dos fatores de transcrição (FTs) previu os FTs regulando genes que codificariam os transcritos induzidos (UR) observados nos perfis de resposta ao estímulo. Também foram identificados transcritos com regulação divergente ou convergente entre os acessos, assim como os FTs exclusivos e os
compartilhados pelos acessos. Os resultados obtidos contribuem para uma melhor compreensão das vias de sinalização do fitohormônio nas respostas de diferentes acessos de feijão caupi após um estímulo de esidratação radicular.

O câncer do colo do útero tem como o principal agente etiológico o Papilomavírus Humano - HPV, com DNA epissomal circular e pequeno, geralmente envolvidos em lesões benignas cutâneas e de mucosas. No entanto, alguns HPVs apresentam potencial carcinogênico e as lesões associadas podem evoluir para o câncer. Atualmente, estão disponíveis três vacinas profiláticas aprovadas e comercializadas, baseadas em partículas semelhantes a vírus, e embora contemplem diversos tipos virais (HPVs 6, 11, 16, 18, 31, 33, 45, 52, 58), não são capazes de tratar tumores existentes ou que possam vir a ser desenvolvidos em pacientes infectados previamente. Por esse motivo, o presente projeto busca desenvolver estratégia terapêutica para o câncer do colo do útero a partir das vacinas de DNA codificantes para os epítopos da oncoproteína E5 do HPV 16. Alguns dos epítopos de E5, adicionados a nossa estratégia vacinal são capazes de induzir a resposta imune celular com perfil de células T citotóxicas, tão necessárias para regressão dos tumores cervicais. Envolvida na progressão, transformação celular, evasão do sistema imune e impedimento da morte por apoptose, a oncoproteína E5 também é expressa nas fases iniciais da infecção, tornando-a atrativa para terapias vacinais que visam às fases iniciais da transformação tumoral. Para tal, avaliamos in vivo a expressão dos respectivos antígenos em fêmeas
C57black, e in vitro a partir de esplenócitos dos camundongos imunizados. Analisamos a resposta imune celular adaptativa (TCD4, TCD8 e TCD16) e decitocinas (IL-2, IL-4, IL-6, IL-10, IL-17 e TNF-α) secretadas por camundongos previamente inoculados com células tumorais C3. Também avaliamos o estresse oxidativo e os níveis toxicológicos induzidos pelo tratamento em modelo animal. Os resultados assinalam a capacidade da construção gênica proposta em induzir regressão de tumores, além de apresentar os melhores resultados entre os grupos avaliados. Os dados sugerem a estratégia E5 multiepítopo como uma possível nova terapia vacinal para tumores induzidos pelo HPV 16.

O câncer cervical é quarta neoplasia mais prevalente em mulheres em todo o mundo. Além disso, sem considerar os tumores de pele não melanoma, o câncer cervical é o primeiro mais incidente na região Norte e o segundo nas regiões Centro-Oeste e Nordeste no Brasil. Os cânceres associados à infecção pelo papilomavírus humano (HPV) incluem desde lesões neoplásicas anogenitais até orofaríngeas. A infecção pelo HPV é principalmente contraída pelo contato sexual, através do qual, microtraumas na mucosa permitem o acesso de partículas virais ao epitélio basal. Devido à alta disseminação de infecções pelo HPV entre indivíduos sexualmente ativos, a proteção contra os cânceres associados ao HPV pela vacinação preventiva ainda é muito restrita. As atividades de proteínas virais E6 e E7 produzidas por HPV de alto risco são apontadas como as principais mediadoras da carcinogênese. O presente estudo objetiva desenvolver estratégias terapêuticas contra lesões associadas à infecção pelo HPV-16, através de elicitação de resposta imune contra epítopos imunogênicos das proteínas E6 e E7 de HPV-16, em modelo pré-clínico. A resposta imune foi incrementada através de associação com o imunomodulador Ii-Padre e sequências linkers, visando à ativação de linfócitos TCD4 e o aumento da apresentação dos antígenos pelo sistema imune, respectivamente. Para confecção da vacina de DNA, os genes de interesse (multi E6, multi E7 e Ii-PADRE) foram clonados em vetor para expressão em célula de mamífero (pVAX) em orientação BamHI/XbaI. Os clones foram confirmados através de PCR, clivagem por enzimas de restrição e sequenciamento de DNA. Além disso, os insertos foram clonados em vetor de expressão bacteriana (pAE)  em orientação BamHI/EcoRI e KpnI/ HindIII, a fim de obter  peptídeos vacinais para imunização dos animais sob regime de prime-boost heterólogo. O desenvolvimento de vacinas de DNA como estratégia terapêutica é um passo crucial para a consolidação de investigação científica, inovação e desenvolvimento tecnológico para o tratamento de doenças de difícil manejo pelos métodos tradicionais, como o câncer.

A levedura Dekkera bruxellensis tem sido frequentemente relacionada a episódios de contaminação, devido a sua capacidade de competir com Saccharomyces cerevisiae por diferentes substratos. A habilidade de D. bruxellensis em assimilar fontes de carbono não utilizadas por S. cerevisiae é um dos fatores associados à
sua alta adaptação nos ambientes industriais. O presente trabalho teve como objetivo avaliar os aspectos fisiológicos e genéticos do metabolismo de açúcares utilizados como substratos para a produção de bioetanol por D. bruxellensis. Para isso, foi realizada uma triagem para a metabolização de açúcares industrialmente
relevantes com diferentes isolados de vinho e etanol. Adicionalmente, foi estudada a capacidade de algumas linhagens em fermentar xilose e arabinose, bem como a influência da glicose no metabolismo dessas pentoses e consequente produção de etanol. Isolados de vinho apresentaram maiores taxas de crescimento em galactose
e os de etanol em celobiose e lactose. Além disso, isolados de etanol foram menos sensíveis a repressão por glicose. Em anaerobiose estrita, os isolados obtiveram altas taxas de crescimento em diferentes açúcares, sem necessidade de suplementação do meio. Os resultados mostram a alta diversidade fenotípica dentro desse grupo quanto a utilização de açúcares. Nos ensaios com xilose e arabinose em aerobiose, essas pentoses foram convertidas preferencialmente a biomassa. Em limitação de oxigênio, o consumo de xilose foi lento com baixa
produção de etanol, ao passo que a arabinose não foi utilizada. Entretanto, a presença de glicose no meio favoreceu o consumo de xilose nessa condição. Nossos resultados sugerem que a glicose pode fornecer intermediários que auxiliam no metabolismo de xilose. Além disso, os dados relevam que o oxigênio é um fator chave no metabolismo de pentoses em D. bruxellensis.

A Terapia Antirretroviral objetiva diminuir a carga viral plasmática e, consequentemente, reconstituir as células T CD4+. Entretanto, entre 15 a 30% dos indivíduos que atingem o sucesso virológico, não se recuperam imunologicamente, condição chamada falha imunológica. Alguns fatores são investigados como causa, dentre eles, a baixa produção de linfócitos T CD4+, processo esse influenciado pela atividade de citocinas, como a IL-10. Alterações na expressão e nos níveis plasmáticos da IL-10 podem estar relacionados à ineficiência da recuperação imunológica. Nesse contexto, a presença de polimorfismos na região promotora do gene IL10, pode influenciar nesse processo. Sendo assim, o estudo objetivou avaliar a influência da IL-10 na falha imunológica de indivíduos vivendo com HIV-1 em TARV. A dosagem sérica da IL-10 foi realizada por citometria (CBA), enquanto a genotipagem dos SNPs ocorreu através de sondas Taqman por PCR em Tempo Real. Foi realizado também o ensaio de quantificação relativa da expressão do gene IL10 por meio do Ct comparativo. Como gene de referência utilizou-se o GAPDH. Com relação à dosagem sérica, não houve diferença significativa entre os grupos IR e INR. O mesmo foi encontrado na genotipagem, onde os genótipos mostraram não interferir nos níveis plasmáticos da IL-10. Já no ensaio de expressão, observouse que o gene IL10 está 3,77 vezes mais expresso no grupo INR comparado ao
IR. Sendo assim, mais avaliações são necessárias para compreensão do processo da falha imunológica