A crescente busca por alternativas sustentáveis e biotecnológicas para a produção de ingredientes funcionais impulsiona a exploração de microrganismos com potencial industrial. Neste contexto, a bioprospecção de fungos filamentosos isolados do ecótono Caatinga-Cerrado visa identificar novas fontes de enzimas de interesse industrial, como a frutosiltransferase (Ftase), responsável pela síntese de frutooligossacarídeos (FOS). Os FOS são prebióticos amplamente utilizados na indústria alimentícia devido aos seus benefícios à microbiota intestinal e propriedades tecnológicas relevantes. Este estudo objetiva isolar e caracterizar fungos filamentosos provenientes do solo e de matéria vegetal em decomposição do ecótono Caatinga-Cerrado, região rica em biodiversidade e ainda pouco explorada biotecnologicamente. As amostras coletadas foram submetidas a técnicas de cultivo seletivo para obtenção de cepas fúngicas com potencial enzimático. A produção de Ftase foi avaliada por ensaios de atividade enzimática utilizando substratos específicos, e a presença de FOS foi confirmada por cromatografia líquida de alta eficiência (HPLC). Os resultados preliminares indicam que algumas cepas apresentam alta capacidade de produção de Ftase em condições otimizadas de pH e temperatura, demonstrando viabilidade para aplicações industriais. Além disso, a caracterização bioquímica e molecular dessas enzimas poderá fornecer subsídios para a aplicação dessas biomoléculas na indústria alimentícia, farmacêutica e biotecnológica. Os achados desta pesquisa reforçam o potencial biotecnológico da biodiversidade brasileira e contribuem para o desenvolvimento de bioprocessos inovadores e sustentáveis. Estudos adicionais de escalonamento e purificação enzimática serão conduzidos para ampliar a aplicabilidade dos FOS obtidos.