Dentre os gêneros de oomicetos causadores de míldios, Pseudoperonospora
se destaca devido ao impacto gerado na agricultura mundial. Uma das espécies mais
importantes desse gênero é a espécie Pseudoperonospora cubensis, conhecida por
causar o míldio das cucurbitáceas, doença relatada em aproximadamente 70 países
e que atinge culturas comerciais importantes da família Cucurbitaceae como o pepino
(Cucumis sativus), a melancia (Citrullus lanatus), as abóboras (Cucurbita máxima, C.
moschata e C. pepo) e o melão (Cucumis melo). Estudos sobre a diversidade e
filogenia de Pseudoperonopsora apontam que a epidemia que ocorreu em 2004 nos
EUA, e as epidemias em outras partes do mundo como Israel e parte da Europa,
podem estar relacionadas ao surgimento de uma nova espécie críptica de
Pseudoperonospora. O conhecimento sobre essa nova possível espécie é o ponto de
partida para o desenvolvimento de cultivares de cucurbitáceas resistentes e para o
manejo eficiente da doença. Portanto, o objetivo deste estudo foi determinar a
filogenia de Pseudoperonospora associada ao míldio das cucurbitáceas em áreas de
diferentes regiões do Brasil. Para isso, foram realizadas coletas de folhas com
sintomas de míldios em áreas de produção de Cucurbitáceas nos estados de
Pernambuco, Minas Gerais, Ceará, Goiás e no Distrito Federal. Para as análises
filogenéticas foi realizada a extração de DNA, depois as reações de PCR utilizando
primers DC-6 e LR-0; Cox2-F e Cox2-RC4; Ypt1F e Ypt4R, para amplificação da
região espaçador transcrito interno (ITS), da região mitocondrial citocromo c oxidase
subunidade II (cox2) e proteína relacionada a Ras (Ypt1), respectivamente. Os
produtos de PCR foram sequenciados e as sequências de nucleotídeos foram
analisadas, editadas e alinhadas para realização da análise filogenética de Inferência
Bayesiana (BI). Para análises morfológicas as estruturas do patógeno foram
montados em lactoglicerol para visualização em microscópio de luz e foram realizadas
30 medições de todos os caracteres morfológicos relevantes. Foram obtidas 36
amostras de DNA de Pseudoperonospora e o sequenciamento resultou em 26
sequencias da região Cox2 e 25 sequencias de ITS (totalizando 51 sequencias). As
análises filogenéticas das regiões genicas Cox2 e ITS foram realizadas
separadamente e em conjunto, o que gerou uma árvore filogenética de ITS que
apresentou um grande grupo monofilético com todos as amostras. Na análise
filogenética de sequências de Cox2 assim como na árvore concatenada (Cox2/ITS)

as amostras do presente estudo foram separadas em dois grupos. A existência
desses dois agrupamentos sugere que no Brasil ocorre diversidade filogenética entre
as linhagens de P. cubensis, reforçando a possibilidade de existirem espécies
crípticas causadoras do míldio das Cucurbitáceas. Porém as análises não apresentam
dados robustos o suficiente para a proposição de uma espécie críptica de P. cubensis.
Como consequência da intima relação filogenética existente nesse grupo são
necessárias análises de genes adicionais com alto sinal filogenético.

Os fungos zigospóricos são encontrados no solo, em folhas, flores, frutos, grãos
estocados e em excrementos de animais herbívoros. Os estudos sobre fungos
zigospóricos coprófilos são escassos e pouco se conhece sobre a estruturação das
comunidades desses fungos em excrementos de mamíferos herbivoros.
Considerando como hipóteses que: 1 - A diversidade e riqueza de fungos zigospóricos
variam entre os tipos de excrementos de animais herbívoros; 2 – A diversidade e
riqueza de fungos zigospóricos nos excrementos de mamíferos roedores são
diferentes das dos excrementos de não roedores; 3 - A alimentação dos animais em
cativeiro reflete nas comunidades de fungos zigospóricos em seus excrementos; 4 –
Os excrementos de mamíferos herbívoros do Recife são reservatórios para novas
espécies de fungos zigospóricos e para espécies ainda não registradas no Brasil, e
mesmo na América do Sul, esse trabalho teve como objetivos principais entender
como as comunidades de fungos zigospóricos são estruturadas nos excrementos de
mamíferos herbívoros, roedores e não rodedores, coletados no Recife-PE, e fornecer
informações ecológicas sobre esse fungos considerando a influência da alimentação
dos animais na estruturação das comunidades dos fungos zigospóricos. Esse trabalho
reporta três espécies novas e aborda os aspectos taxonômicos de primeiras
ocorrências para a América do Sul. Foram realizadas seis coletas de excrementos de
anta, coelho, ouriço, paca, porco-da-índia, veado-catingueiro, no Parque Estadual de
Dois Irmãos, e de excrementos de boi e cavalo, no Departamento de Zootecnia da
Universidade Federal Rural de Pernambuco, localizados no Recife. As amostras foram
acondicionadas em sacos pláticos e levadas ao laboratório para serem incubadas em
câmaras úmidas, por 12 dias, para o acompanhamento do desenvolvimento dos
fungos zigospóricos. Os espécimes foram identificados com base na morfologoia e,
quando necessário, na biologia molecular (regiões ITS e LSU rDNA). As comunidades
de fungos zigospóricos coprófilos foram exploradas quanto à riqueza, diversidade,
equitabilidade, frequência de ocorrência e dissimilaridade. A estrutura das
comunidades foi analisada por NMDS. A correlação de Spearman foi usada a fim de
observar a correlação entre o alimento e a ocorrência dos fungos. Quarenta táxons,
distribuídos entre as ordens Mucorales, Kickxellales e Zoopagales, incluindo novas
espécies e novas ocorrências para América do Sul, foram isolados. Maiores riqueza e
diversidade (Simpson) de fungos zigospóricos foram verificadas nas fezes de porco-

da-índia, mas ambas não variaram para a maioria dos excrementos dos diferentes
animais. A diversidade (Shannon-Wiener) de fungos zigospóricos não variou entre os
excrementos de nenhum dos animais. Não foram verificadas diferenças na riqueza,
diversidade e equitabilidade de fungos zigospóricos entre os excrementos de roedores
e não roedores, mas foi observado que a alimentação dos animais influencia na
estruturação das comunidades dos fungos zigospóricos nos seus excrementos, sendo
Thamnostyllum piriforme, Pilobolus crystalinus e Circinella umbellata as espécies que
mais contribuem para a dissimilaridade entre as comunidades de fungos zigospóricos.

Fungos da ordem Phallales são conhecidos como chifres fedorentos que exalam odor e
atraem insetos, responsáveis pela dispersão dos basidiosporos. Estudos aplicados foram
desenvolvidos com Phallales destacando-se a descoberta de ações antitumorais,
antifúngicas e inseticidas, além de serem utilizados como alimento. Em 2006 foi
publicado o primeiro trabalho com filogenia molecular que representou a ordem
dividida em seis famílias: Clatraceae, Claustulaceae, Lysuraceae, Phallaceae,
Protophallaceae e Trappeaceae. Gastrosporiaceae é incorporada à ordem em 2014, e
mesmo assim tal filogenia não representou todas as sete famílias, o que trouxe dúvidas
em relação ao real posicionamento das famílias em Phallales. Além disso alguns
gêneros da ordem ainda não haviam sido estudados por molecular. Diante disso, o
objetivo geral da tese é reconhecer as relações filogenéticas das famílias de Phallales e
contribuir para a taxonomia e sistemática do grupo. Por meio de análises morfológicas e
moleculares, com materiais oriundos de empréstimo e coletados por parceiros, foram
desenvolvidos cinco artigos que ampliaram o conhecimento do grupo. A filogenia com
as sete ordens de Phallales foi representada; foram descritas quatro novas espécies de
Staheliomyces, novos registros foram publicados para o Brasil e foi desenvolvida uma
revisão do tipo de Colus schellenbergiae e materiais de localidade tipo de Clathrus
columnatus. Nesta tese foi possível constatar que a diversidade de Phallales está
subestimada e ressaltar a importância de trabalhos de base para a construção do
conhecimento do grupo.

Os fungos endofíticos são microrganismos encontrados no interior de tecidos vegetais de modo assintomático, estudados em uma grande variedade de plantas de interesse econômico. No sul da Bahia em sistema agroflorestal, o cacau (Theobroma cacao L.) é cultivado sob a sombra de espécies arbóreas nativas de Mata Atlântica após o raleamento do sub-bosque da floresta, no entanto, os agricultores veem substituindo as árvores sombreadoras nativas por espécies exóticas de valor econômico. Além disso trabalhos sobre a comunidade dos fungos endofíticos em agrofloretas no mundo são escassos. Este estudo teve por objetivo conhecer a comunidade de fungos endofíticos em folhas saudáveis de Cariniana legalis, Paubrasilia echinata e Guarea macrophylla presentes em sistema agroflorestal de cultivo de cacau (cabruca) na Bahia. As folhas foram lavadas em água corrente e detergente neutro e posteriormente fragmentadas em discos foliares (6 mm de diâmetro) e submetidas à desinfestação superficial com álcool 70% (1 min), hipoclorito de sódio 3% (NaOCl) (2 min e 30 s), novamente com álcool 70% (30 s) e a seguir lavadas com água destilada esterilizada. Os discos foram transferidos para placas de Petri contendo (Malte-Dextrose-Ágar) mais cloranfenicol (50 mg L-1). A análise morfológica foi realizada através de literatura especializada, posteriormente foi realizado o sequenciamento dos genes ITS (Internal Transcribed Spacer), TUB2 (β-tubulina) e GAPDH (Gliceraldeído-3- fosfato-desidrogenase) e as análises filogenéticas para confirmação das espécies. Foram obtidos 662 isolados fúngicos distribuídos em 21 gêneros e 43 espécies, principalmente encontrados no filo Ascomycota. Colletotrichum representou o grupo com maior número de isolados, enquanto Diaporthe apresentou o maior número de espécies, sendo C. siamense (15,86%) a espécie mais frequente. Alguns isolados obtiveram baixas similaridades quando comparadas com outras sequências recuperadas do GenBank. Além disso, este é o primeiro relato de N. lacticolonia na região Neotropical isolada de folhas saudáveis de Guarea macrophylla. Ressaltamos a importância de mais estudos sobre a comunidade de fungos endofíticos em sistemas agroflorestais no mundo.

Cocos nucifera L. (Arecaceae) apresenta grande importância econômica e social, sendo a região Nordeste a maior produtora de coco do Brasil. Os mixomicetos (Myxogastria) compõem, juntamente com os fungos de interesse agronômico, a microbiota presentes nos coqueiros e nas palmeiras em geral. Os potenciais bio-indicativo e antagônico destes organismos ainda são pouco estudados, principalmente quando relacionados a espécies de fungos fitopatogênicos. O trabalho teve o objetivo de ampliar o conhecimento acerca da mixobiota associada ao coqueiro, apresentar o potencial dos mixomicetos como bio- indicadores de sanidade foliar e demonstrar seu potencial antagônico a espécie de interesse agronômico. Investigou-se a mixobiota presente em coqueiros da variedade Anã com diferentes níveis de sanidade em coqueiral no município de Bonito (Pernambuco, Brasil) e testou-se a atividade predatória da espécie Diderma chondrioderma (de Bary & Rostaf) G. Lister para o fungo Neopestalotiopsis foedans (Sacc. & Ellis) Maharachch. patógeno a Cocos nucifera. A incidência de mixomicetos nos coqueiros e substratos, composição da mixobiota, riqueza, diversidade
taxonômica, constância, abundância e diversidade das espécies foram analisadas em 60 indivíduos que apresentavam diferentes níveis de doenças foliares causadas por fungos. Foram analisados estipe, estopa , bráctea da inflorescência e bainha da folha em 30 indivíduos apresentando no máximo uma folha sintomática, com até 25% da superfície comprometida (grupo1) e 30 indivíduos com quatro ou mais folhas com comprometimento >25% da superfície foliar (grupo 2). Para o teste de predação in vitro foi realizado o cultivo do plasmódio de D. chondrioderma e o isolamento do fungo N. foedans de folhas sintomáticas de coqueiro. A patogenicidade do isolado fúngico foi testada em mudas assintomáticas. Foram obtidos 128 espécimes com maior incidência na estopa (63%) seguido do estipe (31%), bainha foliar (4%) e bráctea (2%) representando 14 espécies, pertencentes às ordens Physarales e Trichiales, com diversidade taxonômica no grupo G1 maior (S/G=2,25) que a observada no G2 (S/G=2,80). Hemitrichia serpula, Physarum decipiens e Diderma effusum caracterizam a mixobiota. O coeficiente de comunidade (72,7%) e a porcentagem de similaridade (78,3%) evidenciaram semelhança na composição da mixobiota, porém 66,4% dos espécimes e 93% das espécies foram registrados no grupo G2. A espécie de fungo foi identificada como Neopestlaotiopsis foedans e confirmada sua patogenicidade. Observou-se a predação do micélio e conídios de N. foedans, fitopatógeno isolado de C. nucifera, pelo plasmódio de D. chondrioderma, com inviabilidade confirmada. O nível de comprometimento foliar não selecionou as espécies, mas influiu na incidência, abundância, riqueza e diversidade da mixobiota, que podem ser empregadas como parâmetro indicativo do nível de sanidade de coqueiros. O potencial bio controlador de D. chondrioderma em relação a fungo fitopatogênico de interesse agronômico é referido pela primeira vez. Constituindo o primeiro relato de bio-controle para N. foedans.

Os fungos são componentes importantes das cavernas já que participam das
estratégias alimentares da fauna deste ambiente e da decomposição de
matéria orgânica, desenvolvendo assim um papel ecológico importante na
estruturação da comunidade cavernícola. A caverna estudada foi a Furna do
Morcego, localizada no Parque Nacional do Catimbau, no município de
Ibimirim-PE, na Caatinga nordestina e é considerada uma bat cave, Pteronotus
gymnonotus a foi espécie de morcego insetívoro presente nessa na hora da
coleta das amostras. Nesta caverna foram coletas amostras do ar, do guano
dos morcegos e do corpo (asa, pelo e cavidade oral) de 6 espécimes dos
morcegos. As amostras do ar foram obtidas por sedimentação passiva e as do
guano e do corpo foram manipuladas em condições assépticas para o
isolamento dos fungos em meios de cultura. Para identificação, foram
realizadas análises morfológicas e filogenéticas. Representantes dos
Ascomycota e dos Basidiomycota foram encontrados, sendo Ascomycota o filo
dominante. Os gêneros mais frequentes foram Cladosporium, incluindo duas
novas espécies (C. cavernicola e C. pernambucoensis), Aspergillus,
Penicillium, Diaporthe e Fusarium. Poucos gêneros pertenceram ao filo
Basidiomycota, como Sakaguchia, e Rhodotorula. Também foram isoladas
espécies usadas no controle biológico, Beauveria bassiana e na
bioprospecção, Wickerhamomyces anomalus. A presença de fungos nas
cavernas pode representar riscos à saúde humana, podem ser utilizados na
biotecnologia e contribuir com a descoberta de espécies novas para a ciência.

Nasutitermes corniger é considerado uma importante praga urbana, que causa danos a edificações
históricas, construções urbanas, árvores ornamentais e frutíferas. Spodoptera frugiperda e
Dactylopius opuntiae são pragas agrícolas do milho e palma forrageira, respectivamente, que
também podem atacar diferentes culturas. O controle dos referidos insetos é feito com o uso
agrotóxicos, que causa danos ao agroecossistema, saúde do homem e de animais. Como forma de
reduzir este tipo de controle, fungos e extratos vegetais vem sendo estudados. Neste estudo
avaliamos a patogenicidade de 27 isolados do Complexo de Espécies Fusarium incarnatum-equiseti
(FIESC) contra N. corniger e S. frugiperda: quatro Fusarium sulawesiense (= FIESC 16), seis
Fusarium pernambucanum (= FIESC 17) e dezessete Fusarium caatingaense (= FIESC 20).
Avaliamos também o efeito da combinação de URM 6778 e URM 6779 de F. caatingaense
combinados aos extratos aquosos de Ricinnus communis e Nicotiana tabacum no controle de D.
opuntiae no campo. Para os testes de patogenicidade contra N. corniger e S. frugiperda foram
utilizadas suspensões de 1 × 107

conídios/mL. A mesma concentração de esporos foi utilizada no
estudo de campo contra D. opuntiae, para URM 6778 e URM 6779 combinados aos extratos de R.
communis a 5% e N. tabacum a 10% respectivamente. Os compostos químicos biologicamente
ativos dos extratos foram identificados após triagem fitoquímica. Os dados de mortalidade de N.
corniger acumulada ao quinto dia foram submetidos a análise de variância (ANOVA) e as médias
comparadas pelo teste de Scott – Knott (p ≤.05). As variáveis (isolado e tempo) foram submetidos à
análise de regressão. Os dados de mortalidade de D. opuntiae foram corrigidos pela fórmula de
Schneider-Orelli, submetidos a análise de variância (ANOVA) e as médias comparadas pelo teste
Tukey a 5%. A interação dos agentes de controle combinados foi avaliada pela fórmula de
Koppenhöfer et al. (2000). Os resultados do estudo revelaram a ausência de patogenicidade dos
isolados de Fusarium contra S. frugiperda. Contudo, todos os isolados testados contra N. corniger
foram patogênicos, com mortalidade acumulada confirmada de 38,22 – 96%. Os maiores valores de
mortalidade acumulada confirmada foram observados para URM 7560 de F. sulawesiense
(88,89%), URM 7556 de F. pernambucanum (96%) e URM 6783 de F. caatingaense (84,89%). No
estudo de campo os tratamentos combinados apresentaram interação aditiva e foram eficazes no
controle de D. opuntiae, com mortalidade corrigida de 90,82% para URM 6779 + N. tabacum a
10% e 82,11% para URM 6778 + R. communis a 5%.

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