Banca de DEFESA: ZILDENE DE SOUSA SILVEIRA

Uma banca de DEFESA de MESTRADO foi cadastrada pelo programa.
DISCENTE : ZILDENE DE SOUSA SILVEIRA
DATA : 04/02/2022
HORA: 09:00
LOCAL: videoconferência
TÍTULO:

DIVERSIDADE GENÔMICA DE CEPAS DE SARS-CoV-2 DURANTE A PRIMEIRA ONDA DA COVID-19 NO ESTADO DE PERNAMBUCO, BRASIL"

PALAVRAS-CHAVES:

SARS-CoV-2. Pernambuco. Vigilância genômica. Filogenômica.

PÁGINAS: 99
RESUMO:

A Síndrome Respiratória Aguda Grave coronavírus 2 (SARS-CoV-2) é responsável pela pandemia da doença do coronavírus-2019 (COVID-19), a qual levou à notificação de mais de 200 milhões de casos em todo o mundo. Desde então, a vigilância genômica tem sido uma ferramenta fundamental para rastrear a disseminação viral. Neste estudo fornecemos uma análise detalhada da dinâmica temporal de mutações e linhagens de SARS-CoV-2 durante a primeira onda da pandemia no estado de Pernambuco, Brasil. Para isso, realizamos a caracterização de 67 genomas de 22 municípios, os quais foram combinados com 293 sequências de Pernambuco disponíveis no GISAID. Detectamos um total de 962 SNPs em regiões codificantes, a maioria deles localizados na ORF1ab. Observamos padrões dinâmicos de mutações correlacionados a propagação de linhagens ao longo da primeira onda. Observamos a presença de mutações com frequências relativas constantes em Pernambuco durante todo o período de amostragem C241T, C3037T (F924F), C14408T (P4715L/P323L), A23403G (D614G), G28881A (R203K), G28882A (R203R) e G28883C (G204R). Foi detectada a circulação simultânea de 18 linhagens em Pernambuco, sendo as mais prevalentes B.1.1, B.1.1.28, B.1.1.33 e P.2, respectivamente. A rede de haplótipos e a análise filogenômica mostraram que as sequências se agruparam em 4 clados principais de acordo com a dinâmica evolutiva de SARS-CoV-2, tendo havido importações iniciais de linhagens, seguida por expansão e transmissão local de linhagens nacionais, contribuindo para o crescimento acelerado da epidemia regional. Esses resultados evidenciam elevados níveis de diversidade genômica em Pernambuco e destacam a importância de investigações contínuas em vigilância genômica para rastreamento de variantes virais.

MEMBROS DA BANCA:
Externo ao Programa - 2036711 - REGINALDO GONCALVES DE LIMA NETO
Externa à Instituição - ROSANE SILVA
Presidente - 3226717 - VALDIR DE QUEIROZ BALBINO