Banca de QUALIFICAÇÃO: LUCAS ALEXANDRE DE SOUZA COSTA

Uma banca de QUALIFICAÇÃO de DOUTORADO foi cadastrada pelo programa.
DISCENTE : LUCAS ALEXANDRE DE SOUZA COSTA
DATA : 09/12/2021
LOCAL: Videoconferência
TÍTULO:

DIVERSIFICAÇÃO GENÔMICA EM RHYNCHOSPORA VAHL. (CYPERACEAE), UM GÊNERO COM CROMOSSOMOS HOLOCÊNTRICOS

PALAVRAS-CHAVES:

DNA Repetitivo, DNA satélite, elementos transponíveis, sequenciamento por captura de alvo, cromossomos holocêntricos, métodos comparativos filogenéticos

PÁGINAS: 188
RESUMO:

Com os avanços nas técnicas de sequenciamento genômico, foi descoberto que a maior parte do genoma das plantas é composto por DNA repetitivo, especialmente DNAs Satélite e retroelementos-LTR. Apesar de não codificarem proteínas essenciais para o hospedeiro, estas sequências podem alterar o espaço genético/epigenético e promover funções estruturais para determinadas regiões cromossômicas. Além disso, a variabilidade na abundância de diferentes tipos de DNA repetitivo pode estar ligada a respostas naturais destes a estresses ambientais. Nesta tese, buscamos investigar o impacto de diferentes DNAs repetitivos na evolução genômica e diversificação do gênero holocêntrico Rhynchospora Vahl (Cyperaceae). No primeiro capítulo, nós validamos o uso do subproduto de sequenciamento por captura de alvo para a identificação, localização cromossômica e filogenômica comparativa de DNA repetitivo. No segundo capítulo, estudamos a evolução do DNASat Tyba em uma ampla amostragem do gênero, mostrando alta conservação de sequência do satélite, provavelmente ligada à uma possível vantagem estrutural promovida aos holocentrômeros. No terceiro capítulo, investigamos diferentes fatores que possam ter influenciado a abundância de retroelementos-LTR nos genomas de Rhynchospora. Foi visto que a abundância desses elementos é impactada por uma combinação de fatores genômicos, temporais, ambientais e, principalmente, filogenéticos. No geral, nossos resultados contribuem para um maior conhecimento do impacto de Tyba e de retroelementos LTR na evolução genômica de Rhynchospora, além de demonstrar o potencial do estudo de elementos repetitivos num contexto macroevolutivo.

MEMBROS DA BANCA:
Presidente - 154.407.964-87 - LEONARDO PESSOA FELIX - UFPB
Externa à Instituição - MAGDALENA VAIO SCVORTZOFF - URep
Externo à Instituição - PABLO ARIEL MARTINEZ - UFS