Banca de DEFESA: VINICIUS COSTA AMADOR

Uma banca de DEFESA de DOUTORADO foi cadastrada pelo programa.
DISCENTE: VINICIUS COSTA AMADOR
DATA : 03/04/2024
HORA: 14:00
LOCAL: Plataforma Google Meet
TÍTULO:

Análises in silico e in vitro de Peptídeos Bioinspirados de Plantas com Atividade Antimicrobiana Contra Patógenos de Interesse à Saúde Pública

PALAVRAS-CHAVES:

biotecnologia; design de peptídeos; machine learning; Calotropis procera; cito-genotoxicidade; atividade antibacteriana; atividade antifúngica.

PÁGINAS: 156
RESUMO:

A resistência antimicrobiana (AMR) é um grande problema frente ao uso indevido de antibióticos, especialmente no cenário pós-pandêmico, onde a pressão seletiva aumentou a prevalência de patógenos resistentes. Peptídeos antimicrobianos (AMPs) emergem como alternativas promissoras a resistência antimicrobiana especialmente devido ao seu potencial de amplo espectro contra uma variedade de microrganismos. Neste cenário, a bioinformática, utilizando métodos probabilísticos, aprendizado de máquina (ML), desempenha um papel crucial no design de novos fármacos, incluindo peptídeos antimicrobianos, ao facilitar a identificação de alvos terapêuticos e otimizar o perfil de eficácia e segurança dos candidatos a medicamentos como peptídeos bioinspirados (BSAMPs, Bioinspired Short AntiMicrobial Peptides). A flora brasileira é rica em espécies com significativo valor etnobotânico, em vista das práticas tradicionais e medicinais. A espécie Calotropis procera é reconhecida por seu potencial farmacológico, incluindo propriedades anti-inflamatórias e antimicrobianas, evidenciando o potencial de novos fármacos. Neste sentido, o objetivo do presente estudo, focou no desenvolvimento de peptídeos antimicrobianos de amplo espectro contra patógenos de interesse a saúde pública. Para esta finalidade foram mineradas, preditas e caracterizadas, sequências de defensinas e proteínas transferidoras de lipídios, em um banco de dados local cedido pelo Laboratório de Genética e Biotecnologia Vegetal (LGBV) de transcriptoma de Calotropis procera sob estresse salino. BSAMPs (20-Mer) com maior atividade predita foram caracterizados in silico. Os modelos selecionados foram avaliados in vitro quanto à concentração mínima inibitória (MIC) e mínima bactericida/fungicida (MBC/MFC) para S. aureus, A. baumanni, C. gattii e C. albicans, além da citotoxicidade pelo método do MTT. Foram caracterizadas cinco defensin-like putativas com domínio γ-thionin completo como cis em transcriptoma de C. procera sob estresse salino. Seis BSAMPs otimizados quanto à relação atividade-toxicidade foram otimizados pelas métricas de predição, estas, covalidadas por ML. Os BSAMPs apresentaram estruturas tridimensionais diversas, entretanto CpDef1 e CpDef3 se mostraram mais estáveis (RMSD<2Å). Além de estabilidade estrutural, o candidato CpDef1 se mostrou o candidato mais promissor com eficácia em amplo espectro, com ação bactericida/fungicida para S. aureus, A. baumanni, C. gattii e C. albicans em concentrações não citotóxicas considerando o teste de MTT. O presente estudo remontou a eficácia de BSAMPs contra patógenos de interesse a saúde pública e a importância da biodiversidade com vista para bioprospecção de novos peptídeos valorizando a ótica trazida por abordagens in silico como ML no design de novos agentes biotecnológicos. 

MEMBROS DA BANCA:
Presidente - 1134670 - ANA MARIA BENKO ISEPPON
Interno - ***.956.213-** - JOSÉ RIBAMAR COSTA FERREIRA NETO - UFPE
Externo ao Programa - 2282209 - MARCELO ZALDINI HERNANDES - nullExterno à Instituição - RONALD RODRIGUES DE MOURA
Externa à Instituição - THAÍS GAUDENCIO DO RÊGO - UFPB