Banca de DEFESA: AMANDA PEDROSA DA CÂMARA

Uma banca de DEFESA de MESTRADO foi cadastrada pelo programa.
DISCENTE: AMANDA PEDROSA DA CÂMARA
DATA : 06/02/2026
HORA: 09:00
LOCAL: Google meet
TÍTULO:

Identificação e Caracterização do Mobiloma de Cenostigma pyramidale

PALAVRAS-CHAVES:

Bioinformática; catingueira; elementos transponíveis; expressão diferencial; genoma; retrotransposons LTR.

PÁGINAS: 81
RESUMO:

Os elementos transponíveis (TEs) são sequências de DNA móveis que constituem componentes relevantes na organização e na evolução dos genomas vegetais. Inúmeros estudos têm demonstrado a influência que as diferentes condições ambientais exercem sobre a atividade transcricional dos TEs, entretanto, a composição, a diversidade e dinâmica desses elementos ainda permanecem pouco caracterizadas, especialmente em espécies vegetais nativas. A Cenostigma pyramidale - espécie nativa da Caatinga e reconhecida por sua notável tolerância à salinidade - destaca-se como um modelo vegetal particularmente relevante para o estudo, especialmente no contexto da resposta e da dinâmica dos seus TEs (mobiloma) frente a condições de estresse salino. Com base nisso, este estudo realizou a identificação e a caracterização do mobiloma da catingueira, com ênfase nos retrotransposons LTR, integrando análises genômicas e transcriptômicas. A anotação global dos TEs foi conduzida a partir do genoma da espécie, utilizando-se os programas RepeatModeler e RepeatMasker, sendo posteriormente refinada por análises específicas voltadas aos retrotransposons LTR, por meio das ferramentas AnnoTEP e DANTE_LTR. A dinâmica transcricional foi avaliada por meio da análise de dados de RNA-Seq obtidos de três bibliotecas de RNA (geradas a partir de 3 tratamentos: 30 minutos, 2 horas e 11 dias após estresse salino, NaCl 100mM), empregando-se o pacote edgeR. Os resultados mostraram que 354,9 Mb (46,37%) do genoma da catingueira correspondem a repetições intercaladas. Dentre os elementos da Classe I, observou-se o predomínio dos retrotransposons do tipo LTR (144,7 Mb; 18,91% do genoma), enquanto, que na Classe II, a fração mais representativa foi de transposons do tipo TIR (68,1 Mb; 8,90%). Dentre os retrotransposons LTR, a superfamília LTR/Copia foi a mais abundante (6,7%), com destaque para a linhagem Ale (4,45%). A análise de divergência indicou a presença de sequências com baixa divergência (~9%), principalmente entre os elementos LTR, resultado compatível com eventos de inserção relativamente recentes no genoma. A análise de expressão revelou um maior número de transcritos candidatos a TEs diferencialmente modulados (314 regulados positivamente e 356 regulados negativamente) após 11 dias de estresse salino, indicando um padrão de modulação transcricional responsivo à exposição prolongada ao estresse. Esses achados ampliam o conhecimento sobre a composição, a abundância relativa e o perfil transcricional dos elementos transponíveis em C. pyramidale, estabelecendo um panorama do mobiloma genômico e transcriptômico da espécie sob diferentes tempos de exposição ao estresse salino.

MEMBROS DA BANCA:
Externa à Instituição - ISADORA LOUISE ALVES DA COSTA RIBEIRO
Interno - ***.978.684-** - RODRIGO CESAR GONCALVES DE OLIVEIRA - UPE
Presidente - 1061810 - VALESCA PANDOLFI