INFERINDO PROCESSOS MICRO- E MACROEVOLUTIVOS COM BASE EM DADOS GENÔMICOS: SISTEMÁTICA E EVOLUÇÃO DO CLADO MALVATHECA (MALVACEAE)
Malvatheca; Repetoma; Evolução Reticulada; Ceiba pentandra; Paleopoliploide; Filogenômica; Hibridização in situ Fluorescente (FISH)
O clado Malvatheca (Malvaceae Juss.) é composto por três subfamílias — Bombacoideae (com alto número de cromossomos, principalmente árvores), Malvoideae (menor número de cromossomos, principalmente ervas) e a recentemente descrita Matisioideae — apresentam relações não resolvidas, com várias espécies de posicionamento incerto. Esse clado, apresenta 66 milhões de anos e múltiplos eventos de paleopoliploidia, sendo um modelo para estudos de mecanismos de diploidização e evolução reticulada. Esta dissertação investiga os processos micro e macroevolutivos que moldaram a história evolutive desse clado, focando na fração repetitiva de seus genomas (repeatoma) como fonte de informação. A dissertação compreende dois capítulos. No primeiro, revisitamos a disjunção África/Amazônia da samaúma (Ceiba pentandra (L.) Gaertn.). Identificamos dois clados, Neotropical e Paleotropical (que inclui indivíduos cultivados na Ásia e América do Sul). Nossos dados sugerem que a origem da espécie é Neotropical com a colonização da África por dispersão à longa distância 30 milhões de anos atrás. A análise citogenômica mostrou alta estabilidade no mobiloma entre indivíduos da África e das Américas, apesar da divergência profunda dessas linhagens. Sugerimos que o hábito arbóreo, com ciclos de vida longo, estao associadas a baixas taxas de divergência cariotípica e genômica. No segundo capítulo, uma análise filogenômica de 62 espécies do clado Malvatheca revelou a existência de três clados: Bombacoideae, Malvoideae e um grupo heterogêneo com representantes de Matisioideae, Malvoideae e táxons incertos. Evidências de reticulação foram encontradas, com incongruências entre topologias plastidiais e nucleares. Espécies de posição incerta localizavam-se nos pontos de incongruência, revelando uma associação entre evolução reticulada a incertezas taxonômicas. Nós obervamos uma correlação inversa entre números cromossômicos e diversidade dos repeats. Assim, ao contrário das outras subfamílias Bombacoideae, com alto número cromossômico, mostrou baixa diversidade de repeats. Esses resultados também pode estar associado ao hábito arbóreo, o que demonstra que a forma de vida parece impactor tanto em processos micro- quanto macroevolutivos em Malvatheca. Esses capítulos fornecem uma compreensão abrangente da história do clado Malvatheca com base na análise comparativa dos repeatomas, sugerindo que os elementos repetitivos possuem um elevado potencial para estudos de sistemática e evolução.