A região Nordeste do Brasil corresponde a maior taxa de produção pesqueira do país. Ainda há pouco conhecimento sobre predadores oceânicos extintos, mas a exploração esgota as populações de peixes marinhos em 50% a 70%, e a gestão atual da pesca depende de avaliações de estoque para estimar parâmetros populacionais de espécies focais com o histórico da estrutura de capturas, biomassa, esforço pesqueiro e inspecções de pesca independentes. O papel da avaliação pesqueira é encontrar o melhor suporte técnico voltado para questões políticas, sociais e econômicas. O objetivo principal do presente estudo foi reconstruir a captura da fauna alvo e acessória, avaliando se houve variações na abundância e tamanho no tempo e no espaço para seis espécies mais capturadas. Os resultados evidenciaram, comparando três programas de pesca, que o aparelho utilizado para as capturas promoveram mudanças nos aspectos populacionais, principalmente para Prionace glauca (tubarão azul). Medidas para o manejo pesqueiro da fauna alvo e acessória no Oceano Atlântico Sul devem ser seguidas para evitar o colapso das populações.