Banca de QUALIFICAÇÃO: BRUNA DE BRITO SOUZA

Uma banca de QUALIFICAÇÃO de DOUTORADO foi cadastrada pelo programa.
DISCENTE : BRUNA DE BRITO SOUZA
DATA : 09/06/2022
LOCAL: Google meet / Às 09:00
TÍTULO:

GENÔMICA ESTRUTURAL, COMPARATIVA E FUNCIONAL DE GENES DE HELICASES EXPRESSOS EM VIGNA UNGUICULATA (L.) WALP SOB ESTRESSE ABIÓTICO

PALAVRAS-CHAVES:

Expressão gênica; Bioinformática; Transcriptômica; DDX-box.

PÁGINAS: 181
RESUMO:

A seca é um dos fatores limitantes para a produtividade do feijão-caupi, que apesar de algumas variedades serem tolerantes, seu desempenho ainda é afetado. As DNA e RNA helicases, são enzimas onipresentes que atuam tanto no desenrolamento de fitas duplas por um processo dependente de ATP, quanto na resposta ao estresse abiótico, por meio da melhoria nos parâmetros bioquímicos e fotossintéticos da planta, sendo este um sistema de defesa positivamente correlacionado ao aumento na tolerância. O objetivo do estudo foi identificar e caracterizar a nível estrutural os genes para helicases em V. unguiculata, e analisar a expressão no transcriptoma RNA-Seq de raízes de feijão-caupi sob condição de desidratação radicular (25 e 150 min.). Foram identificados 148 potenciais genes, dentre os quais, 45 são codificadores de DNA (RuvB, MCM, RecQ, PIF1, UvrD e RecG) e 103 de RNA (DEAD, DEAH/DExH-D) helicases. Com base na variação no motivo II e análise fenética, das RNA helicases, 56 proteínas são DEAD-box e 47 DEAH/DExH-box. As DEAD-box apresentaram nove motivos conservados, enquanto a conservação nas extensões N e C terminal das DEAH foi nitidamente inferior. Na região promotora dos genes para RNA helicases estão associadas as famílias de fatores de transcrição: AP2-ERF, MADS-box, C2H2, Doftype e bHLH-ZIP. Dentre os transcritos para DNA e RNA helicases diferencialmente expressos (DE; FDR <0,05), dos nove relacionados a família DEAD-box, quatro foram reprimidos inicialmente e induzidos com a intensificação do estresse e, outros quatro foram induzidos em ambos os tempos. Total de 14 transcritos codificando RuvB, oito UvrD, nove MCM e dez RecQ, foram DEs em função aos estímulos. Esses resultados contribuem para compreensão da resposta transcricional do feijão-caupi frente ao estímulo estudado e os genes DE são alvos promissores e uteis ao melhoramento genético.

MEMBROS DA BANCA:
Presidente - 1293690 - ANA CHRISTINA BRASILEIRO VIDAL
Externa à Instituição - FLAVIA FIGUEIRA ABURJAILE - UFPE
Externo à Instituição - MARCUS VINÍCIUS LOSS SPERANDIO