Distribuição e padrões da contaminação ambiental porSARS-CoV-2 e desenvolvimento de um teste do tipo “point-of-care” para o diagnóstico da COVID-19
Risco de Transmissão; Diagnóstico; Validação; RT-LAMP; COVID-19; SARS-CoV-2.
A COVID-19 causada pelo SARS-CoV-2, disseminou-se mundialmente desde o seu primeiro registro no final de 2019 em Wuhan, China, sendo declarada como uma pandemia pela OMS. O SARS-CoV-2 infecta humanos e é altamente transmissível a partir do contato direto com pessoas infectadas, ou por contato indireto através de superfícies contaminadas. Atualmente, a técnica padrão-ouro para diagnóstico do SARS-CoV-2 é a RT-qPCR, porém por apresentar limitações, alguns métodos alternativos estão sendo explorados. Devido a sua sensibilidade, versatilidade, robustez e baixo custo, a técnica RT-LAMP tem sido aplicada para a detecção do SARS-CoV-2. Diante do exposto, este estudo teve por objetivo avaliar as medidas mais eficazes para controlar a pandemia da COVID-19, desde a análise da transmissibilidade em áreas urbanas públicas, até o desenvolvimento de uma plataforma diagnóstica baseada em RT-LAMP para detecção do SARS-CoV-2 em amostras humanas. Um total de 400 amostras de superfícies foram coletadas em fevereiro de 2021 no Recife, 24.2% foram positivas para o SARS-CoV-2 por RT-qPCR e 97.4% dos locais de coleta apresentaram pelo menos uma amostra de superfície contaminada. Em paralelo, ensaios RT-LAMP para detecção do SARS-CoV-2 foram conduzidos para padronização da técnica, avaliação da sensibilidade e especificidade, assim como validação clínica com 317 amostras humanas coletadas entre 2020 e 2021. O ensaio RT-LAMP apresentou elevada sensibilidade (~ 95%) e detectou o SARS-CoV-2 a partir de 15 minutos, sem necessidade de extração de RNA. O desempenho diagnóstico foi similar a RT-qPCR porém com otimização do tempo e custo cerca de 40x menor. Os dados apresentados fornecem informações quanto a dispersão do SARS-CoV-2 em Recife, cidade muito afetada pela COVID-19 e demonstra os pontos de controle críticos para interrupção da cadeia de transmissão do SARS-CoV-2. Além disso, visando controlar a pandemia em curso a partir da testagem em massa, a plataforma diagnóstica aqui desenvolvida servirá para aplicação em ponto de atendimento, especialmente em áreas com pouco recursos.