Banca de DEFESA: BRUNA DE BRITO SOUZA

Uma banca de DEFESA de DOUTORADO foi cadastrada pelo programa.
DISCENTE: BRUNA DE BRITO SOUZA
DATA : 27/10/2023
HORA: 08:00
LOCAL: Videoconferência
TÍTULO:
GENÔMICA ESTRUTURAL, COMPARATIVA E FUNCIONAL DE GENES DE HELICASES E SNF2 EM Vigna unguiculata (L.) Walp APÓS DESIDRATAÇÃO RADICULAR

PALAVRAS-CHAVES:
Bioinformática; Transcriptômica; DEAD/DEAH; cromatina

PÁGINAS: 256
RESUMO:
As helicases são enzimas essenciais para o splicing, transporte, e degradação dos
RNAs, e para o início da tradução destes, enquanto que as proteínas remodeladoras
de cromatina Snf2 facilitam a interação de proteínas na expressão gênica, estando
ambas associadas a respostas a estresses abióticos. A seca limita a produtividade do
feijão-caupi, mesmo em variedades tolerantes. O objetivo do estudo foi identificar e
caracterizar a estrutura e função de helicases e Snf2 em Vigna unguiculata (L.) Walp.,
e analisar sua expressão em ensaio RNA-Seq após desidratação radicular (de 25 e
150 minutos). Foram identificados 187 genes potenciais, incluindo 46 helicases de
DNA (RuvB, MCM, RecQ, PIF1, UvrD e RecG), 103 RNA helicases (DEAD,
DEAH/DExH-D) e 39 Snf2 (Snf2-like, Swr1-like, Rad54-like, Rad5/16-like, SSO1653-
like e SMARCAL1-like), nos 11 cromossomos do genoma. A duplicação segmentar
predominou para helicases e em tandem para Snf2. Na região promotora dos
respectivos genes, foram previstos fatores de transcrição relacionados com respostas
a estresses, incluindo ERF, Dof, Myb, TCP, ARF e bZip. A estrutura dos éxons-íntrons
mostrou-se conservada nas famílias gênicas. Proteinas helicases/Snf2 apresentaram
domínios e motivos conservados da Superfamília 2 de helicases, com variações nas
regiões N e C terminais. Alguns transcritos RNA-Seq, como VuDEAD25.1,
VuDEAD74.1, VuSNF2_22.1, VuSNF2_21.1 e VuSNF2_4.1, apresentaram resposta
diferencial aos estímulos, sendo induzidos em 150 minutos. A Rede interativa de MCM
e RuvB sugeriu participação principalmente no ciclo celular, regulação transcricional,
resposta ao estresse e reparo de DNA. Esses resultados indicam alvos que podem
ser explorados em programas de melhoramento do feijão, como transgenes ou
marcadores moleculares.

MEMBROS DA BANCA:
Presidente - 1171216 - EDERSON AKIO KIDO
Externo à Instituição - JOAO PACIFICO BEZERRA NETO - UPE
Externo à Instituição - MARCUS VINÍCIUS LOSS SPERANDIO - UFRPE
Externo à Instituição - NATONIEL FRANKLIN DE MELO - EMBRAPA
Interno - 1551125 - TERCILIO CALSA JUNIOR
Notícia cadastrada em: 03/10/2023 14:35
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