Estudo molecular de mecanismos enzimáticos de resistência aos antimicrobianos betalactâmicos e relação clonal de isolados clínicos de Enterobacterales provenientes de colonização e de infecção em pacientes com e sem covid-19 em um hospital público de Recife-PE
Enterobacterales, Genes de Resistência e Resistência a antimicrobianos.
Pacientes diagnosticados com covid-19 são frequentemente colonizados e posteriormente podem vir a desenvolver coinfecções, em sua maioria por bactérias gram-negativas, que podem ou não estar relacionadas a cepas clonais. Com ênfase para cepas produtoras de betalactamases, que degradam os antibióticos de última escolha, dificultando a terapêutica do paciente. Este estudo teve por objetivo investigar e comparar a presença dos principais genes e enzimas de resistência aos carbapenêmicos, bem como a relação clonal entre os isolados
clínicos da ordem Enterobacterales derivados de colonização e infecção em pacientes com e sem Covid-19 provenientes de um hospital público de Recife-PE, Brasil, entre 2021 e 2022. Portanto, foram analisados 45 isolados clínicos da ordem Enterobacterales resistentes aos carbapenêmicos, provenientes de diferentes pacientes com ou sem Covid-19, com resultado confirmado por RT-PCR. Para a investigação de genes de resistência (bla KPC , bla GES , bla OXA-48-LIKE, bla NDM , bla VIM e bla IMP ), suas variantes foram submetidas a técnica de PCR, seguida de sequenciamento de amplicons, e posteriormente os isolados foram submetidos à técnica de tipagem por ERIC-PCR. As espécies resistentes aos carbapenêmicos mais isoladas foram Klebsiella pneumoniae, Serratia marcescens e Proteus mirabilis. Os genes de resistência
detectados foram bla NDM (46,66%) e bla KPC (35,55%) e minoritariamente ocorreu a detecção concomitante de bla NDM e bla KPC (17,77%). Este é o primeiro relato de P. mirabilis e Enterobacter cloacae, carreando o gene bla NDM-5 , nas Américas e fora da Ásia, respectivamente. Os resultados da tipagem pela ERIC-PCR mostraram alta variabilidade genética nas cepas de K. pneumoniae, P. mirabilis, P. stuartii e S. marcescens. Os resultados da comparação entre o teste rápido Carba-NG-5 demonstraram índices de sensibilidade de 91,66% e especificidade de 92,30% para os genes bla KPC e para o gene bla NDM os índices foram sensibilidade de 92,30% e especificidade de 91,66%. Em conclusão, o gene bla NDM foi o principal gene de resistência detectado nos isolados clínicos de Enterobacterales. Após sequenciamento, foram identificadas as variantes bla NDM-5 e bla NDM-7 , que conferem maior capacidade hidrolítica contra os betalactâmicos, foi descrito a presença de cepas multi-clonais em espécies de Enterobacterales demonstrando a necessidade de estudos mais aprofundados sobre o tema com o fim de monitoramento mais frequente dessas variantes.