Investigação e comparação da relação clonal e variabilidade genética de isolados clínicos de K.pneumoniae resistentes aos carbapenêmicos e aminoglicosídeos antes e durante a pandemia de covid-19 em um hospital público de Recife-PE.
Carbapenemases, metilases, AMES, covid-19 e resistência
A resistência bacteriana aos antimicrobianos constitui uma grande crise de saúde pública mundial, agravada durante a pandemia da covid-19, quando cerca de 94 a 100% pacientes com covid-19 utilizaram algum antimicrobiano, principalmente os de última escolha, como carbapenêmicos e aminoglicosídeos. A Klebsiella pneumoniae é o principal bacilo gram-negativo fermentador envolvido em Infecções Relacionadas à Assistência à Saúde (IRAS), como também foi a bactéria que mais co- infectou pacientes com covid-19. Essa espécie pode apresentar diversos mecanismos de resistência, como exemplo a produção de enzimas beta-lactamases e enzimas modificadoras de aminoglicosídeos. Considerando que ainda não se sabe quais os impactos do uso indiscriminado de antimicrobianos na resistência e variabilidade genética da K. pneumoniae durante a pandemia, é importante determinar os clones STs e o seu perfil de resistência antes, durante e após a pandemia de covid-19 Portanto, o presente estudo tem como objetivo investigar e comparar a ocorrência de clones STs e o perfil genético e fenotípico de resistência aos carbapenêmicos e aminoglicosídeos de isolados clínicos de K.pneumoniae antes (2019) e durante quatro anos de pandemia de covid-19 (2021, 2022, 2023 e 2024) em um hospital público de Recife-PE. Serão analisados cerca de 100 isolados de K.pneumoniae, fenotipicamente, de acordo com a concentração inibitória mínima de antimicrobianos (CLSI), como também geneticamente através de PCR e sequenciamento de DNA. A identificação dos genes de resistência aos carbapenêmicos (bla KPC e bla NDM ) e aos aminoglicosídeos (aac(3)-Ia, aac(3)-IIa, ant(2”)-Ia, aac(6’)-Ib, aph(3’), armA, rmtB, rmtD, rmtG) será realizada pela técnica de PCR, seguida do sequenciamento de DNA dos amplicons. Para análise da variabilidade genética e relação clonal será realizado a ERIC-PCR e MLST (Tipagem de Sequência Multilocus). Será realizada a seleção de isolados para realização da técnica de MLST para se determinar quais clones estavam presentes durante esses períodos (2019, 2021, 2022, 2023 e 2024) e o seu perfil molecular de resistência. Os resultados desse estudo irão contribuir para o conhecimento a respeito do aumento da variabilidade genética, de clones ST e de genes resistência aos aminoglicosídeos (armA, rmtB, rmtD, rmtG, aac(3)-Ia, aac(3)-IIa, ant(2”)-Ia, aac(6’)-Ib, , e aph(3’)-VI) e carbapenemicos (bla KPC e bla NDM ) durante a pandemia de covid-19 em isolados de K.pneumoniae. Determinar os clones ST é necessário, pois podem estar envolvidos em surtos locais, aumentando a possibilidade de se disseminarem e se tornarem endêmicos ou pandêmicos. Adicionalmente, com os resultados desse estudo espera-se auxiliar nos dados nacionais sobre resistência bacteriana colaborando para que equipes de saúdem tenham uma melhor orientação na terapêutica e controle dessas infecções